Pod koniec 1939 r. w Krakowie Jan Krokowski spotkał swego przyjaciela z lat gimnazjalnych, Fryderyka Gansa.
Gans, który uciekł z obozu przejściowego, zwrócił się do Krokowskiego z prośbą o pomoc. Polak postarał się o wyrobienie metryki chrztu i pozostałych dokumentów dla członków zaprzyjaźnionej rodziny. Kolegę, który zgodnie z „aryjskimi papierami” miał się nazywać Alfred Górny, ulokował u znajomej w Bronowicach Małych, na obrzeżach Krakowa, zaś jego rodziców przyjął do swego mieszkania, w którym mieszkał z żoną, matką i synem. Dzięki znajomościom Jana Fryderyk Gans został zatrudniony w firmie transportowej, w której pracował sam Krokowski.
Po utworzeniu krakowskiego getta Polak przewiózł rodziców przyjaciela do Bochni. Dostarczał im żywność i lekarstwa. Kiedy zmarł ojciec Fryderyka, Adolf, Krokowski zorganizował mu pogrzeb, zaś wdowę ze względów bezpieczeństwa przewiózł do wsi Zabierzów.
Po wojnie Jan i Fryderyk utrzymywali przyjacielskie kontakty. 28 marca 1988 r. Instytut Yad Vashem włączył Jana Krokowskiego w poczet Sprawiedliwych wśród Narodów Świata.